Durante una seduta di Neurofeedback il paziente viene fatto accomodare su una poltrona in modo che si rilassi e si senta a suo agio. Davanti a sé ha un computer. Il trainer che lo segue posiziona sul suo capo alcuni elettrodi (strumenti di rilevazione dell'attività cerebrale). Agli elettrodi sono collegati dei fili sottili che trasmettono il segnale direttamente al computer. In questo modo il paziente vede le proprie onde cerebrali visualizzarsi sullo schermo del computer. Nel caso di un paziente adulto queste visualizzazioni sono sotto forma di barre colorate, ad un bambino appaiono invece sottoforma di videogioco. Lo scopo del training è quello di accrescere l'attenzione del paziente e diminuire la sua tendenza a distrarsi. Se il paziente non è concentrato e rilassato la visualizzazione si interrompe e non emette alcun feedback visivo e sonoro, allo stesso modo il videogioco del bambino smette di funzionare fino a che non riacquisti la concentrazione. Il processo di autocontrollo è inizialmente una capacità inconscia. Man mano che il paziente riesce a mantenere costante l'attività visualizzata sul computer assimila la modalità con cui questo avviene.

La terapia quindi, si basa sulla percezione attiva del paziente che impara progressivamente a modulare la propria attività cerebrale sotto la guida del terapeuta e del computer. Il terapeuta addestrato appositamente, condivide passo a passo il percorso terapeutico sostenendone la motivazione, verificando i progressi e modulando la terapia a seconda dei risultati raggiunti.

Un training completo prevede circa 30-40 sedute, in genere due o tre a settimana, per cui il tempo complessivo varia dai 3 ai 7 mesi.